肝(gan)內(nei)膽(dan)管癌(Intrahepatic Cholangiocarcinoma,ICC)是(shi)(shi)僅次于肝(gan)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)肝(gan)癌的(de)第(di)二大(da)(da)(da)常(chang)見原發(fa)(fa)性(xing)肝(gan)惡(e)性(xing)腫(zhong)瘤,近年(nian)來(lai)發(fa)(fa)病(bing)率呈(cheng)增長趨(qu)勢,具有起病(bing)隱(yin)匿(ni)、高(gao)度(du)侵襲、高(gao)度(du)異(yi)質(zhi)(zhi)、預后不良等特點。其中(zhong)(zhong),起病(bing)隱(yin)匿(ni)、高(gao)異(yi)質(zhi)(zhi)性(xing)是(shi)(shi)影響(xiang)肝(gan)內(nei)膽(dan)管癌靶向及免疫治療效果的(de)重(zhong)要因素。為解析肝(gan)內(nei)膽(dan)管癌發(fa)(fa)展不同時期腫(zhong)瘤組織內(nei)部(bu)的(de)動(dong)態異(yi)質(zhi)(zhi)性(xing),西安交通大(da)(da)(da)學(xue)電(dian)信(xin)學(xue)部(bu)自動(dong)化學(xue)院葉凱教(jiao)授與華中(zhong)(zhong)科技大(da)(da)(da)學(xue)李(li)蕾教(jiao)授團隊建立肝(gan)內(nei)膽(dan)管癌小鼠模型,采集時序單細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)轉錄組數據(ju),整合多維組學(xue)數據(ju),分析驗證了調控(kong)腫(zhong)瘤異(yi)質(zhi)(zhi)性(xing)的(de)關鍵(jian)調控(kong)網絡、早期起源(yuan)細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)、關鍵(jian)驅動(dong)基因、內(nei)皮纖(xian)維細(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)在腫(zhong)瘤發(fa)(fa)生發(fa)(fa)展過程中(zhong)(zhong)的(de)動(dong)態相互作用。
研究(jiu)發(fa)現在肝(gan)內膽(dan)管(guan)癌腫瘤細(xi)(xi)胞(bao)(bao)中(zhong)(zhong)存在應(ying)激反應(ying)和增殖(zhi)性(xing)腫瘤亞型(xing)。使用基(ji)因(yin)共(gong)表(biao)達、圖網絡挖掘等機(ji)器學(xue)習方法首次(ci)發(fa)現兩(liang)種腫瘤亞型(xing)中(zhong)(zhong)異(yi)質性(xing)的(de)(de)(de)轉錄因(yin)子及(ji)調(diao)控網絡。首次(ci)發(fa)現并驗(yan)證肝(gan)臟內部上皮細(xi)(xi)胞(bao)(bao)從分化到(dao)癌化過(guo)程中(zhong)(zhong)的(de)(de)(de)關鍵(jian)驅動(dong)基(ji)因(yin),并首次(ci)發(fa)現頂端內皮細(xi)(xi)胞(bao)(bao)在響(xiang)應(ying)纖維細(xi)(xi)胞(bao)(bao)刺激的(de)(de)(de)同時促(cu)進纖維細(xi)(xi)胞(bao)(bao)的(de)(de)(de)重塑,最終(zhong)促(cu)進腫瘤細(xi)(xi)胞(bao)(bao)增殖(zhi)的(de)(de)(de)動(dong)態過(guo)程及(ji)分子機(ji)制。本研究(jiu)報道的(de)(de)(de)多種關鍵(jian)細(xi)(xi)胞(bao)(bao)類型(xing)和驅動(dong)基(ji)因(yin)提(ti)升了領域對肝(gan)內膽(dan)管(guan)癌的(de)(de)(de)發(fa)病機(ji)制及(ji)瘤內異(yi)質性(xing)的(de)(de)(de)認(ren)識,為診斷和治療(liao)提(ti)供了新的(de)(de)(de)靶(ba)點。

該項研(yan)究(jiu)工作(zuo)依托于西(xi)安(an)交通(tong)(tong)(tong)大學(xue)(xue)醫(yi)學(xue)(xue)部第一附屬醫(yi)院(yuan)單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)測序平臺(tai),Med-X研(yan)究(jiu)院(yuan)數字醫(yi)學(xue)(xue)研(yan)究(jiu)所(suo),電(dian)子與信息研(yan)究(jiu)院(yuan)生物信息學(xue)(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)三個干濕(shi)結合平臺(tai)。研(yan)究(jiu)成果以“基于單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)轉錄組的肝內膽管癌起始發展細(xi)胞(bao)(bao)異質(zhi)性研(yan)究(jiu)”(Cellular heterogeneity and transcriptomic profiles during intrahepatic cholangiocarcinoma initiation and progression)為(wei)(wei)題發表在《肝病學(xue)(xue)》。西(xi)安(an)交通(tong)(tong)(tong)大學(xue)(xue)為(wei)(wei)該論文(wen)(wen)第一作(zuo)者(zhe)單(dan)位,西(xi)安(an)交通(tong)(tong)(tong)大學(xue)(xue)電(dian)信學(xue)(xue)部自動化學(xue)(xue)院(yuan)王庭杰博(bo)士生與華中科(ke)技大學(xue)(xue)徐(xu)傳瑞教(jiao)授(shou)為(wei)(wei)文(wen)(wen)章共同(tong)第一作(zuo)者(zhe)。葉凱教(jiao)授(shou)為(wei)(wei)末(mo)位通(tong)(tong)(tong)訊(xun)作(zuo)者(zhe),李蕾(lei)教(jiao)授(shou)為(wei)(wei)該論文(wen)(wen)共同(tong)通(tong)(tong)(tong)訊(xun)作(zuo)者(zhe)。
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